Troy Dawson ogłosił wydanie systemu Scientific Linux 4.9. Jest to ostatnie wydanie z serii 4.x. Seria ta bazuje na dystrybucji Red Hat Enterprise Linux 4.9. System działa od kontrolą jądra w wersji 2.6.9 oraz serwera graficznego X.Org 6.8.2. W systemie znajdziemy takie oprogramowanie jak glibc 2.3.4, GCC 3.4.6. Do wyboru są dwa środowiska graficzne: GNOME 2.8 oraz KDE 3.3.
Wydanie to nie zawiera żadnych nowych funkcji. Aktualizuje tylko posiadane oprogramowanie i eliminuje kilka znalezionych błędów. Pełna lista zmian znajduje się w notce o wydaniu.